More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2851 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 
278 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  92.09 
 
 
278 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  70.65 
 
 
276 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  70.22 
 
 
278 aa  345  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  71.21 
 
 
281 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  71.21 
 
 
281 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  71.21 
 
 
278 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  70.45 
 
 
279 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  70.08 
 
 
279 aa  332  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  68.73 
 
 
282 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  68.73 
 
 
282 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  68.73 
 
 
282 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  68.73 
 
 
282 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  68.73 
 
 
282 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  69.4 
 
 
282 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  68.36 
 
 
282 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  69.58 
 
 
262 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  68.28 
 
 
278 aa  314  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  60.67 
 
 
290 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  59.93 
 
 
268 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  56.46 
 
 
270 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  56.46 
 
 
270 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  56.67 
 
 
269 aa  246  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  50.57 
 
 
281 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  47.73 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  49.44 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  50.19 
 
 
263 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  49.81 
 
 
263 aa  209  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  46.97 
 
 
269 aa  206  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  49.06 
 
 
268 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  45.72 
 
 
270 aa  205  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  47.76 
 
 
269 aa  203  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  45.39 
 
 
269 aa  202  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  47.83 
 
 
272 aa  201  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  46.62 
 
 
269 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  43.82 
 
 
276 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  47.04 
 
 
270 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  46.82 
 
 
270 aa  190  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  42.32 
 
 
265 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  43.35 
 
 
270 aa  185  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  42.29 
 
 
274 aa  181  9.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  43.02 
 
 
262 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  44.05 
 
 
268 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  39.53 
 
 
260 aa  180  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  42.64 
 
 
262 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  45.38 
 
 
267 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  43.65 
 
 
263 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  43.35 
 
 
265 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  43.35 
 
 
265 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 
263 aa  169  4e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  44.03 
 
 
260 aa  168  8e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  39.31 
 
 
257 aa  167  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  40.87 
 
 
270 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  37.8 
 
 
261 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  40.32 
 
 
263 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  43.67 
 
 
252 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  36.48 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  37.8 
 
 
263 aa  155  8e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  43.27 
 
 
252 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
263 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  42.68 
 
 
254 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  39.38 
 
 
263 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  42.59 
 
 
266 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  38.55 
 
 
263 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  41.06 
 
 
254 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  41.87 
 
 
254 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  42.51 
 
 
254 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  36.4 
 
 
266 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  54.86 
 
 
141 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  56.94 
 
 
141 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  55.56 
 
 
141 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  56.25 
 
 
141 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  55.56 
 
 
141 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  41.3 
 
 
254 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  56.46 
 
 
140 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  40.16 
 
 
254 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  54.86 
 
 
141 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  54.86 
 
 
141 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  40.65 
 
 
254 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  38.76 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  55.48 
 
 
141 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  60.14 
 
 
142 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.84 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.25 
 
 
263 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  51.05 
 
 
142 aa  133  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.25 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  35.21 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  37.12 
 
 
264 aa  131  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  39.18 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  53.85 
 
 
143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  49.65 
 
 
155 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.65 
 
 
263 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  51.72 
 
 
142 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  51.05 
 
 
142 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.29 
 
 
298 aa  125  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
263 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  51.05 
 
 
142 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.06 
 
 
263 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  46.9 
 
 
142 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>