More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0567 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  80.97 
 
 		 290 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  58.46 
 
 		 270 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  58.46 
 
 		 270 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 279 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  59.93 
 
 		 278 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  58.52 
 
 		 279 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 278 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 278 aa  255  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  58.43 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  56.83 
 
 		 269 aa  251  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  55.85 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  58.21 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  58.96 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  58.96 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  58.96 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  58.96 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  58.96 
 
 		 282 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  58.58 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  58.65 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  48 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  46.04 
 
 		 269 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  45.66 
 
 		 268 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  46.21 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  46.79 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  47.17 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 268 aa  195  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  45.42 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  43.98 
 
 		 270 aa  191  8e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  43.13 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  43.61 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  41.51 
 
 		 269 aa  185  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  44.66 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  44.83 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  39.31 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  47.71 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  47.71 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 269 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  43.97 
 
 		 267 aa  178  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  42.59 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  40.64 
 
 		 270 aa  171  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  41.94 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  41.46 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 274 aa  166  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  35.19 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  44.53 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  39.02 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  43.72 
 
 		 252 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  56.12 
 
 		 142 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  40.49 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.68 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.68 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.68 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  35.41 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  39.18 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.46 
 
 		 263 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  55.07 
 
 		 141 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1175  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.6 
 
 		 263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  39.02 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  53.24 
 
 		 141 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3537  ModE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000170049  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  36.74 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  52.52 
 
 		 141 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  53.62 
 
 		 142 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  52.52 
 
 		 142 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  52.52 
 
 		 141 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  34.43 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  52.52 
 
 		 141 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.25 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  52.9 
 
 		 141 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  34.46 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  50.36 
 
 		 141 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  53.96 
 
 		 142 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  45.64 
 
 		 155 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  53.96 
 
 		 140 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0770  ModE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 259 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0744  ModE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139669 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0682  DNA-binding transcriptional regulator ModE  40.48 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>