More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1638 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 
269 aa  540  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  65.02 
 
 
270 aa  343  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  66.41 
 
 
270 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  59.11 
 
 
269 aa  329  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  62.98 
 
 
268 aa  330  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  64.31 
 
 
269 aa  328  4e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  61.71 
 
 
269 aa  323  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  61.98 
 
 
263 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  61.6 
 
 
263 aa  319  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  55.06 
 
 
269 aa  296  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  57.47 
 
 
281 aa  295  5e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  45.63 
 
 
270 aa  227  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  43.51 
 
 
272 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  42.41 
 
 
270 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  46.82 
 
 
278 aa  201  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  43.35 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  46.97 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  42.59 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  42.44 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  42.44 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  42.44 
 
 
278 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  40.38 
 
 
265 aa  195  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  42.44 
 
 
279 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  41.51 
 
 
268 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  42.07 
 
 
279 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  38.17 
 
 
262 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  39.48 
 
 
276 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  38.17 
 
 
262 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  41.13 
 
 
268 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  40.91 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  42.97 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  60.28 
 
 
141 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  39.31 
 
 
263 aa  178  8e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  38.8 
 
 
270 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  38.06 
 
 
269 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  40.65 
 
 
274 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  43.15 
 
 
267 aa  176  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  38.29 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  38.29 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  40.77 
 
 
265 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  40.77 
 
 
265 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  41.44 
 
 
282 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  53.9 
 
 
141 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  39.38 
 
 
257 aa  167  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  61.7 
 
 
141 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  40.86 
 
 
260 aa  162  6e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  37.02 
 
 
263 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  40.91 
 
 
282 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  40.91 
 
 
282 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  40.91 
 
 
282 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  40.91 
 
 
282 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  40.91 
 
 
282 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  40.91 
 
 
282 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  41 
 
 
262 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  36.43 
 
 
266 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  37.96 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
267 aa  155  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.1 
 
 
260 aa  154  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  38.06 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  34.21 
 
 
263 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  35.5 
 
 
263 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  34.59 
 
 
263 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  37.65 
 
 
263 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  36.64 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  50 
 
 
142 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  33.99 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  34.52 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  35.04 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  35.57 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  35.92 
 
 
254 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  45.71 
 
 
141 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  33.88 
 
 
254 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  46.43 
 
 
141 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
258 aa  123  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  35.1 
 
 
252 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.74 
 
 
263 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  45.71 
 
 
141 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  33.08 
 
 
263 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  35.77 
 
 
254 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  44.29 
 
 
141 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  43.57 
 
 
141 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  45 
 
 
141 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  45 
 
 
141 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  33.2 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  35.09 
 
 
266 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  32.39 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.22 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  45 
 
 
141 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  33.74 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  45 
 
 
140 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  31.3 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  42.55 
 
 
177 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.07 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.15 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.15 
 
 
298 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  44.68 
 
 
142 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  45.32 
 
 
142 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  31.08 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  34.16 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>