More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0976 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 
270 aa  543  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  44.78 
 
 
272 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  47.45 
 
 
269 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  47.51 
 
 
268 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  47.92 
 
 
290 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  44.36 
 
 
276 aa  205  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  46.69 
 
 
268 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  44.27 
 
 
270 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  47.67 
 
 
263 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  47.29 
 
 
263 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  44.66 
 
 
265 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  44.49 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  45.95 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  47.08 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  45.17 
 
 
281 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  45.17 
 
 
278 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  45.17 
 
 
281 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  46.36 
 
 
279 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  44.75 
 
 
269 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  46.59 
 
 
269 aa  192  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  45.35 
 
 
281 aa  192  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  46.9 
 
 
270 aa  192  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  45.98 
 
 
279 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  46.15 
 
 
269 aa  191  8e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  41.54 
 
 
262 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  44.87 
 
 
278 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  42.41 
 
 
269 aa  186  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  45.72 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  44.61 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  44.92 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  41.64 
 
 
270 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  44.81 
 
 
267 aa  176  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  40.32 
 
 
270 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  44.62 
 
 
260 aa  176  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  43.31 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  45.35 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  41.7 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  43.35 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  40.38 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  43.45 
 
 
265 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  43.45 
 
 
265 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  41.67 
 
 
270 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  41.67 
 
 
270 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  41.3 
 
 
263 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  38.08 
 
 
263 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  45.45 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  45.45 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  45.45 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  45.45 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  45.45 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  45.45 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  38.11 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  45.02 
 
 
282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  38.76 
 
 
257 aa  150  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  39.53 
 
 
263 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  37.25 
 
 
261 aa  149  6e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.82 
 
 
260 aa  148  7e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  33.2 
 
 
263 aa  142  8e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  37.04 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39 
 
 
263 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  37.6 
 
 
267 aa  135  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  31.3 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  55.07 
 
 
142 aa  133  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  35.54 
 
 
263 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.78 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  35.12 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  35.54 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.45 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.45 
 
 
298 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.07 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.52 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  34.98 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  34.3 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.16 
 
 
262 aa  122  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1175  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.29 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  36.55 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  36.03 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0784  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.15 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.96 
 
 
269 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  33.73 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2881  transcriptional regulator, ModE family  36.25 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000144972  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0864  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.25 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108345  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2901  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.25 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.052498  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.25 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0682  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.25 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0788  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.25 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  48.59 
 
 
142 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  48.55 
 
 
141 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  36.36 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  48.55 
 
 
142 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  47.83 
 
 
142 aa  112  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  35.46 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  46.38 
 
 
142 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  36.25 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  36.47 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  44.93 
 
 
141 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  45.65 
 
 
143 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  46.38 
 
 
142 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>