245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6011 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  100 
 
 		 141 aa  268  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  97.16 
 
 		 141 aa  261  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  91.49 
 
 		 141 aa  251  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  91.49 
 
 		 141 aa  249  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  91.49 
 
 		 141 aa  249  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  91.49 
 
 		 141 aa  249  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  82.27 
 
 		 141 aa  230  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  75.89 
 
 		 141 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  82.27 
 
 		 142 aa  208  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  74.47 
 
 		 140 aa  208  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  73.76 
 
 		 177 aa  202  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  59.57 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  59.57 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 278 aa  140  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  53.47 
 
 		 278 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  54.29 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  55.32 
 
 		 262 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  55.32 
 
 		 282 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  55.32 
 
 		 282 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  55.32 
 
 		 282 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  55.32 
 
 		 282 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  55.32 
 
 		 282 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 268 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 278 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 278 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 281 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 281 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  54.61 
 
 		 282 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  54.23 
 
 		 282 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 290 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 278 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 276 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  51.43 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  48.57 
 
 		 269 aa  124  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  46.43 
 
 		 269 aa  124  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  48.2 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 279 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 268 aa  124  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  50 
 
 		 272 aa  122  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 279 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  48.23 
 
 		 281 aa  121  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 276 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  50 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  45.71 
 
 		 268 aa  120  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  47.14 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  46.43 
 
 		 270 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  46.81 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  48.57 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 269 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 274 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  45.71 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  48.94 
 
 		 267 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  47.83 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  47.52 
 
 		 263 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  46.81 
 
 		 263 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  44.29 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  49.29 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  48.94 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  47.14 
 
 		 270 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  45.71 
 
 		 270 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  45 
 
 		 269 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  44.29 
 
 		 269 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 270 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  46.1 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  45.07 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  43.48 
 
 		 265 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  43.48 
 
 		 265 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  41.13 
 
 		 378 aa  100  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 263 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  42.18 
 
 		 270 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  42.18 
 
 		 270 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 262 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  44.2 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  44.2 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 267 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  39.73 
 
 		 269 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1548  molybdenum-pterin binding protein  42.03 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.98183  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  40 
 
 		 262 aa  94.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  43.26 
 
 		 142 aa  94.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  38.57 
 
 		 265 aa  94.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  37.86 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  42.75 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  38.13 
 
 		 270 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 261 aa  90.9  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  42.96 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 263 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  39.72 
 
 		 263 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  36.23 
 
 		 270 aa  87.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  42.25 
 
 		 452 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  35.25 
 
 		 260 aa  87  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2199  TOBE domain-containing protein  38.69 
 
 		 356 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0871  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.14 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180666  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  36.17 
 
 		 263 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 263 aa  80.9  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.86 
 
 		 260 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  36.36 
 
 		 263 aa  77.8  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3411  TOBE domain protein  34.29 
 
 		 359 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>