More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1692 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 		 263 aa  524  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  98.1 
 
 		 263 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  68.94 
 
 		 270 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  67.3 
 
 		 269 aa  349  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  67.05 
 
 		 269 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  68.44 
 
 		 268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  68.2 
 
 		 270 aa  333  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  61.98 
 
 		 269 aa  329  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  63.98 
 
 		 269 aa  322  5e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  56.76 
 
 		 281 aa  289  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  57.03 
 
 		 269 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  48.66 
 
 		 270 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  51.12 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  49.81 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  44.11 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  71.13 
 
 		 141 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 281 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 281 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  45.02 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  41 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  42.64 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  44.08 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 278 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  41.91 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  68.31 
 
 		 141 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  41.15 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  38.7 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  41.06 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  43.41 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  59.86 
 
 		 141 aa  168  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  39.63 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  39.63 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  44.7 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  45.45 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  45.45 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  45.45 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  45.45 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  45.45 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  45.42 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  39.69 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  39.69 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  45.45 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  36.5 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  34.98 
 
 		 263 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  57.45 
 
 		 142 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  35.5 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.71 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.74 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  34.83 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  35.63 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.88 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.88 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.5 
 
 		 263 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.34 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.09 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.07 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1175  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.85 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  38.87 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  37.4 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  36.95 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  38.46 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  46.1 
 
 		 141 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0929  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.95 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.177252 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  45.07 
 
 		 177 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0874  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.95 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  46.81 
 
 		 141 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0906  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.55 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0843  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.55 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.55 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  46.48 
 
 		 142 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0784  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.71 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  45.39 
 
 		 141 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0788  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.74 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>