More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4402 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  70.65 
 
 		 278 aa  349  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  71.01 
 
 		 278 aa  349  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  66.42 
 
 		 281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  66.42 
 
 		 281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  66.42 
 
 		 278 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 278 aa  318  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  64.07 
 
 		 279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  63.91 
 
 		 279 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 278 aa  298  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  64.02 
 
 		 282 aa  295  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  60.5 
 
 		 282 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  60.5 
 
 		 282 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  60.5 
 
 		 282 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  60.5 
 
 		 282 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  60.71 
 
 		 282 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  60.14 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  63.71 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 290 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  52.04 
 
 		 270 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  52.04 
 
 		 270 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  52.04 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  46.37 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  45.25 
 
 		 281 aa  195  6e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  44.36 
 
 		 269 aa  195  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  44.96 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  42.97 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  42.97 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  43.73 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  45.45 
 
 		 263 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  44 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  44.7 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  39.41 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  42.08 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  40.75 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  43.43 
 
 		 262 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  38.46 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  35.23 
 
 		 263 aa  159  6e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  39.36 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  39.39 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  39.75 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  43.03 
 
 		 252 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  38.58 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  39.6 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  42.59 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  42.59 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  54.55 
 
 		 142 aa  145  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  41.39 
 
 		 252 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  42 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  38.43 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  38.4 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  52.48 
 
 		 140 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  54.55 
 
 		 143 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.5 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  40.82 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  48.94 
 
 		 141 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  53.15 
 
 		 142 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  50.35 
 
 		 141 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  51.06 
 
 		 141 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.02 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  51.77 
 
 		 141 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  53.15 
 
 		 142 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  49.65 
 
 		 141 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.45 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.12 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.69 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  49.65 
 
 		 141 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  49.65 
 
 		 141 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  38.93 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.5 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  48.94 
 
 		 141 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.08 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  50 
 
 		 142 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  39.18 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1175  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.26 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  53.19 
 
 		 142 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.6 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  49.65 
 
 		 142 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>