More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2964 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  100 
 
 		 269 aa  540  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  67.3 
 
 		 263 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  67.3 
 
 		 263 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  63.43 
 
 		 270 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  59.11 
 
 		 269 aa  325  4.0000000000000003e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  65.41 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  62.08 
 
 		 269 aa  314  9e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  59.85 
 
 		 269 aa  311  6.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  61.94 
 
 		 270 aa  310  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  56.39 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  51.34 
 
 		 270 aa  254  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  87.94 
 
 		 141 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  85.11 
 
 		 141 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 268 aa  211  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  49.06 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 279 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  44.18 
 
 		 272 aa  208  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  49.81 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  43.6 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  40.54 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  40.91 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  42.91 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  42.25 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  47.21 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  46.84 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  46.84 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  46.84 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  46.84 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  46.84 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  48.28 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  39.62 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  47.55 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  63.83 
 
 		 141 aa  184  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  45.31 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  41.26 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  41.26 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  42.86 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  37.96 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  39.54 
 
 		 265 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  39.54 
 
 		 265 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  37.4 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  36.26 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  38.28 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  55.71 
 
 		 142 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 261 aa  152  8e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  36.6 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  35.38 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.83 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.96 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  35.47 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  36.19 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  50.35 
 
 		 142 aa  128  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.08 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  33.46 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  47.86 
 
 		 141 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  50 
 
 		 141 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3537  ModE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000170049  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  48.57 
 
 		 141 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  50.71 
 
 		 140 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.63 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  34.72 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.62 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  48.57 
 
 		 141 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.62 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  46.81 
 
 		 142 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  49.29 
 
 		 141 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  47.14 
 
 		 141 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.23 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.08 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  35.63 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  50.36 
 
 		 142 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>