More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0447 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 
268 aa  529  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  65.4 
 
 
270 aa  337  8e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  68.44 
 
 
263 aa  332  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  68.06 
 
 
263 aa  331  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  62.98 
 
 
269 aa  329  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  65.41 
 
 
269 aa  324  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  64.64 
 
 
269 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  65.77 
 
 
270 aa  316  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  63.46 
 
 
269 aa  311  9e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  59.16 
 
 
269 aa  296  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  59.3 
 
 
281 aa  294  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  51.55 
 
 
270 aa  249  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  46.69 
 
 
270 aa  218  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  44.74 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  50.57 
 
 
278 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  45.66 
 
 
268 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  44.66 
 
 
272 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  46.56 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  49.06 
 
 
278 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  43.92 
 
 
270 aa  195  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  46.84 
 
 
278 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  46.84 
 
 
281 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  46.84 
 
 
281 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  44.53 
 
 
268 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  48.52 
 
 
279 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  47.39 
 
 
278 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  47.78 
 
 
279 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  41.92 
 
 
262 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  43.95 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  41.54 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  46.56 
 
 
278 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  41.6 
 
 
257 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  37.69 
 
 
265 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  65.96 
 
 
141 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  47.51 
 
 
282 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  43.45 
 
 
276 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  47.15 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  47.15 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  47.15 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  47.15 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  47.15 
 
 
282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  47.15 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  47.13 
 
 
262 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  40.24 
 
 
274 aa  171  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  40.52 
 
 
270 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  40.52 
 
 
270 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  41.76 
 
 
265 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  41.76 
 
 
265 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 
263 aa  170  3e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  58.16 
 
 
141 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  39.18 
 
 
269 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  38.55 
 
 
270 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  68.09 
 
 
141 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.1 
 
 
260 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  38.62 
 
 
263 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  40.08 
 
 
260 aa  151  8e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  38.87 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  35.25 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  34.35 
 
 
263 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
263 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  36.59 
 
 
263 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  38.62 
 
 
263 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  53.57 
 
 
142 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  40 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  37.65 
 
 
263 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  35.51 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  36.55 
 
 
267 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  37.96 
 
 
254 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  33.07 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  34.01 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  36.68 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.87 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  39.51 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  38.52 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  49.65 
 
 
142 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  48.94 
 
 
142 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  31.33 
 
 
263 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  46.1 
 
 
177 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  34.6 
 
 
258 aa  122  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  45.71 
 
 
141 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.18 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  37.19 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  48.57 
 
 
141 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  45 
 
 
141 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  45.71 
 
 
141 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  45.71 
 
 
141 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  47.86 
 
 
140 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  45.71 
 
 
141 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  45.71 
 
 
141 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  45.71 
 
 
141 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  38.11 
 
 
252 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2881  transcriptional regulator, ModE family  37.65 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000144972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0682  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.65 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.65 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0784  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.65 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0788  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.65 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2901  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.65 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.052498  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0864  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.65 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108345  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  50.36 
 
 
142 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  45.39 
 
 
142 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>