228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2640 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  537  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  73.48 
 
 		 267 aa  380  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  52.31 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  43.94 
 
 		 264 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  41.29 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  34.54 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  34.17 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  34.94 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  35.54 
 
 		 265 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  35.54 
 
 		 265 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  33.21 
 
 		 270 aa  138  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 270 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  34.66 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 269 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  34.39 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  31.43 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  34.27 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  33.74 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  30.92 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  29.3 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  30.77 
 
 		 270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  32.68 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  35.47 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  32.54 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  35.47 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  35.47 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  35.47 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  35.47 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  35.47 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  35.47 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  34.19 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  31.54 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  27.34 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  31.95 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  31.95 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  26.98 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 263 aa  98.6  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  29.55 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  28.22 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  31.62 
 
 		 270 aa  95.9  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  31.13 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  30.56 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  27.17 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  28.86 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  31.44 
 
 		 269 aa  89  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  27.87 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  27.17 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  27.68 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  37.41 
 
 		 141 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  28.46 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  28.86 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1175  DNA-binding transcriptional regulator ModE  29.01 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  28.46 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  28.96 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  36.23 
 
 		 141 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 254 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  28.1 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  35.51 
 
 		 141 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  36.96 
 
 		 141 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  35.51 
 
 		 141 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  27.72 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  38.85 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  35.51 
 
 		 141 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  34.78 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  30.94 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  34.06 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  38.3 
 
 		 141 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  37.59 
 
 		 142 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  25.48 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  35.51 
 
 		 141 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  31.43 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3537  ModE family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000170049  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  35.33 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>