209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6143 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 
114 aa  236  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  50.47 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  44.66 
 
 
263 aa  97.1  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  44.04 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  43.1 
 
 
265 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  46.74 
 
 
125 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  47.19 
 
 
114 aa  85.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  46.15 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  39.56 
 
 
107 aa  84.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  37.27 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  48.24 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  48.08 
 
 
258 aa  82  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  43.56 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  43.96 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  43.21 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  43.96 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  42.73 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  42.86 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  42.11 
 
 
257 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  42.35 
 
 
262 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  42.35 
 
 
262 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  43.81 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  45 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  39.77 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  41.49 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  44.12 
 
 
269 aa  74.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  39.05 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  42.31 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  44.16 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  43.14 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  35.71 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  38.46 
 
 
270 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  38.46 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  38.46 
 
 
270 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  38.46 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  36.96 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  38.46 
 
 
269 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  43.75 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  43.81 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  43.27 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  31.53 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  39.29 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  45 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  39.05 
 
 
270 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  38.2 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
263 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  44.12 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  35.16 
 
 
263 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  36.9 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  34.91 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  38.1 
 
 
269 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  36.67 
 
 
263 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  32.99 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  38.75 
 
 
268 aa  63.9  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  39.42 
 
 
269 aa  63.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  50.65 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
290 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 
278 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  42.27 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  35.29 
 
 
266 aa  62.8  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  43.16 
 
 
177 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  44.94 
 
 
254 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
263 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  36.26 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  44.94 
 
 
254 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  49.32 
 
 
254 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  44.05 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  39.42 
 
 
263 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  31.31 
 
 
111 aa  60.5  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
247 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
125 aa  60.5  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  39.42 
 
 
263 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  41.76 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  44.58 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  35.24 
 
 
268 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  31.65 
 
 
260 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  30.19 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
278 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  40.45 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
281 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  39.05 
 
 
278 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
281 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
278 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  33.94 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  32.11 
 
 
195 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  31.65 
 
 
261 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
279 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
278 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  31.73 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  42.5 
 
 
274 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  43.82 
 
 
252 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
279 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 
236 aa  57.4  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>