171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3511 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  321  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 171 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  41.54 
 
 		 139 aa  100  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  46.61 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  41.32 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  40 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  37.74 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  37.38 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  33.04 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  34.51 
 
 		 245 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  34.82 
 
 		 233 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  34.82 
 
 		 233 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  35.92 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  38.46 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  34.41 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  36.11 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  44.26 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 258 aa  57.8  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  52.08 
 
 		 265 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  36.36 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  47.27 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  35.42 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  36.9 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  35.23 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  38.2 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  50 
 
 		 257 aa  53.9  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  35.29 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  41.27 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  39.29 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  42.86 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  28.18 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 269 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  36.89 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  48 
 
 		 177 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  48.98 
 
 		 366 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  48.98 
 
 		 366 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  32.79 
 
 		 270 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.38 
 
 		 368 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 195 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.38 
 
 		 368 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.38 
 
 		 368 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  46.51 
 
 		 270 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  32.79 
 
 		 270 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2363  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.38 
 
 		 368 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  56.41 
 
 		 263 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  46.94 
 
 		 366 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  35.63 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0730  molybdate metabolism transcriptional regulator  53.06 
 
 		 360 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.739883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  36.36 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  32.04 
 
 		 263 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  35.63 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  50 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  34.26 
 
 		 272 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4147  molybdate metabolism transcriptional regulator  33.59 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.70321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0896  molybdate metabolism transcriptional regulator  44.9 
 
 		 365 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0898  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.15 
 
 		 368 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0910  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.15 
 
 		 368 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527444  normal  0.0178578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  41.18 
 
 		 369 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  44.44 
 
 		 345 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  37.93 
 
 		 270 aa  47.4  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  45.45 
 
 		 268 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  33.01 
 
 		 270 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3075  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  44.44 
 
 		 346 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  44.19 
 
 		 269 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  44.68 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  58.82 
 
 		 267 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  45.28 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  35.37 
 
 		 263 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0339  molybdate metabolism transcriptional regulator  38.46 
 
 		 358 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  30.97 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 281 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>