189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0650 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 		 136 aa  275  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 171 aa  153  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  58.12 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  46.09 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  41.23 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 123 aa  84.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  38.89 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  32.46 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  43.18 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  38.68 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  35.79 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.21 
 
 		 195 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  45.59 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  37.65 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  32.29 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  35.19 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0963  molybdate metabolism transcriptional regulator  50.77 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.549295  hitchhiker  0.00109251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  35.24 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  35.24 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 242 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  38.2 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  39.53 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2967  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  44.3 
 
 		 353 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  33.02 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  46.81 
 
 		 263 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0045  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.51 
 
 		 297 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3075  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  44.3 
 
 		 346 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  44.3 
 
 		 345 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  36.05 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  30 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  37.35 
 
 		 269 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7451  LysR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 302 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  36.9 
 
 		 257 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  43.66 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  32.58 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2870  molybdate metabolism transcriptional regulator  46.38 
 
 		 372 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 318 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 315 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  36.9 
 
 		 270 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 315 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  31.31 
 
 		 245 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  48.84 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1822  molybdate metabolism transcriptional regulator  56.1 
 
 		 386 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 315 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 315 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  31.31 
 
 		 233 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  31.31 
 
 		 233 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  32 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 279 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 269 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  40.58 
 
 		 369 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 316 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  48.84 
 
 		 263 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  38.04 
 
 		 272 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  41.51 
 
 		 264 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 258 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 267 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  40.45 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.62 
 
 		 368 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 316 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.62 
 
 		 368 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 268 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3479  regulatory protein LysR  52.27 
 
 		 373 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1508  molybdate metabolism transcriptional regulator  42.03 
 
 		 375 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0210  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  57.5 
 
 		 348 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  35.56 
 
 		 269 aa  44.7  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 279 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.62 
 
 		 368 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0730  molybdate metabolism transcriptional regulator  51.16 
 
 		 360 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.739883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2692  transcriptional regulator, LysR family  48.28 
 
 		 312 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  32.14 
 
 		 266 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0041  transcriptional regulator, LysR family protein  38.46 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  32.43 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  32.58 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3787  transcriptional regulator, LysR family  52.27 
 
 		 358 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>