72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1450 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  100 
 
 		 111 aa  220  6e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  53.21 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  31.82 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  30.63 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  39.78 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  33.7 
 
 		 245 aa  57.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  31.73 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  33 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  28.16 
 
 		 242 aa  53.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  38.67 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  29.35 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  28.26 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  27.17 
 
 		 233 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  27.18 
 
 		 245 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  27.08 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  34.19 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 236 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  31.58 
 
 		 262 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 262 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  31.68 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 258 aa  47  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 260 aa  47  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  29 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  37.93 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  22.92 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  32.88 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  25.51 
 
 		 263 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  40.35 
 
 		 263 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  38.6 
 
 		 263 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 268 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  32 
 
 		 266 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 270 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 276 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  30.28 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 		 125 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 141 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  24.3 
 
 		 126 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4147  molybdate metabolism transcriptional regulator  28.75 
 
 		 368 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.70321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  26.04 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  35.09 
 
 		 268 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  28.57 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  28.95 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 115 aa  41.2  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  33.73 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  26.92 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  24.73 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  33.73 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  23.6 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  37.25 
 
 		 269 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>