89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01590 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  100 
 
 		 114 aa  236  8e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  52.34 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  53.04 
 
 		 114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  35.78 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  37.61 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  36.19 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  30.77 
 
 		 242 aa  57  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  33.67 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  25.23 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  33.67 
 
 		 233 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  33.67 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  34.44 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  34.26 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  44.26 
 
 		 366 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  44.26 
 
 		 366 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  36.9 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 		 247 aa  52  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  42.62 
 
 		 366 aa  50.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  31.43 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  32.69 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0896  molybdate metabolism transcriptional regulator  42.31 
 
 		 365 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0932  regulatory protein, LysR  33.33 
 
 		 365 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658319  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  29.36 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  31.62 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  37.04 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  34.38 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  26.21 
 
 		 245 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  31.11 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  22.92 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  31.91 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0339  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.51 
 
 		 358 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  31.82 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3618  transcriptional regulator, LysR family  38.81 
 
 		 301 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  29.9 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  29.9 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3807  transcriptional regulator, LysR family  38.81 
 
 		 301 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.832757  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  39.29 
 
 		 319 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 115 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  33.33 
 
 		 177 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 296 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  32.35 
 
 		 270 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  28.16 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6795  transcriptional regulator, LysR family  34.72 
 
 		 302 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.775917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0898  molybdate metabolism transcriptional regulator  26.32 
 
 		 368 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0910  molybdate metabolism transcriptional regulator  26.32 
 
 		 368 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527444  normal  0.0178578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1678  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 318 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2363  molybdate metabolism transcriptional regulator  27.19 
 
 		 368 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0099  LysR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 298 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0442  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 316 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0102  LysR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 298 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3086  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 312 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0099  LysR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 298 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000782403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1763  HTH-type transcriptional regulator  35.21 
 
 		 300 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0991  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 302 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  31.11 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  35 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  30 
 
 		 195 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  30.85 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  26.32 
 
 		 368 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0854  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.81 
 
 		 297 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  26.32 
 
 		 368 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0073  LysR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 303 aa  40  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4147  molybdate metabolism transcriptional regulator  26.32 
 
 		 368 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.70321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  26.32 
 
 		 368 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>