More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0442 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0442  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4124  transcriptional regulator, LysR family  51.16 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.175412 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0918  LysR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 313 aa  318  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4033  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 308 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00663025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2202  LysR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.871962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1176  transcriptional regulator, LysR family  50.36 
 
 		 297 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000040335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2941  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0449  LysR family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000587967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0530  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.979074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1206  transcriptional regulator, LysR family  40.36 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000040335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1268  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 335 aa  222  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00300028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2882  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0714  LysR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  23.35 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  26.12 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  26.12 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1919  LysR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301552  normal  0.616957 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0727  LysR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  24.74 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2242  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.46 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4032  LysR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  24.23 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2971  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.12 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3225  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.3 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  23.59 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2414  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1477  LysR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.876533  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  23.59 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3061  transcriptional regulator, LysR family  25.19 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.638597  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5503  transcriptional regulator, LysR family  26.74 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  23.91 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  24.01 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4525  LysR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1902  LysR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4804  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0414707 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  24.16 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3818  LysR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0306  LysR family regulatory protein  25.79 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489462  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1385  LysR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134108  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  22.07 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  23.19 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5829  transcriptional regulator, LysR family  24.43 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.59 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0110  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1546  LysR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0468693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  28.29 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1974  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168317  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.67 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0026  LysR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.615193  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3102  transcriptional regulator, LysR family  22.05 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2316  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  26.42 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1114  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0058  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3896  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.738753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2901  transcriptional regulator, LysR family  26.83 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108446  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0643  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  31.69 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0399655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3808  LysR family substrate binding transcriptional regulator  31.69 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0747  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  23.83 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  23.63 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  23.63 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12140  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  25.16 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0535  LysR family regulatory protein  25.4 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.077291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  24.16 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  24.4 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0356  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  22.04 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1201  LysR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.02 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4372  transcriptional activator TtdR  24.05 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0240245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0344  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2440  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.79 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.924518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2436  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.79 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0199714 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  23.66 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2550  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.79 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3535  putative transcription regulator  25.09 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  22.18 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  25.93 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2348  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.79 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000261353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2914  transcriptional regulator, LysR family  26.69 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0105427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1191  putative transcriptional regulator  22.53 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2392  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.79 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  hitchhiker  0.00212314 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0630  transcriptional regulator, LysR family  24.07 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000148774  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>