More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2941 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2941  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  632  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0449  LysR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 326 aa  364  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000587967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0530  LysR family transcriptional regulator  57.19 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.979074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4124  transcriptional regulator, LysR family  50.51 
 
 		 308 aa  316  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.175412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4033  transcriptional regulator, LysR family  51.88 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00663025  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0442  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2202  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.871962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0918  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1176  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 297 aa  225  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000040335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1268  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00300028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1206  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000040335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2882  transcriptional regulator, LysR family  36.13 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0630  transcriptional regulator, LysR family  26.86 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000148774  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0345  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  23.08 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2180  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.69 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  23.71 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.69 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4477  transcriptional regulator, LysR family  27.8 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0714  LysR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3635  LysR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287506  normal  0.0415744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  25.85 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0727  LysR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  25.51 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25320  transcriptional regulator  25.33 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  25.51 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  25.51 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2350  transcriptional regulator, LysR family  21.88 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  26.49 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  24.09 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3509  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1191  putative transcriptional regulator  23.67 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3892  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2790  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  25.86 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  25.77 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1631  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4370  LysR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  28.39 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1347  transcriptional regulator, LysR family  27.07 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.98443  normal  0.727871 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3095  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  32.57 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1623  transcriptional regulator, LysR family  29.81 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4105  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  32.12 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  25.91 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  25.93 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1546  LysR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0468693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0996  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2971  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.28 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.14 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6838  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0910  transcriptional regulator  24.54 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5814  LysR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2251  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.149084  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3423  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1961  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1003  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0953  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3573  hypothetical protein  28.87 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>