More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1877 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
297 aa  597  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 
307 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  44.98 
 
 
302 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 
308 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 
307 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 
308 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 
302 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 
319 aa  231  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
303 aa  231  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 
318 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  39.73 
 
 
314 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
298 aa  222  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0263  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 
322 aa  222  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  41.81 
 
 
314 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0637  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 
312 aa  219  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
299 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.83 
 
 
300 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 
298 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 
304 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 
304 aa  205  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
296 aa  205  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
294 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
297 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 
296 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  36.97 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  39.58 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
297 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 
297 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
295 aa  195  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 
297 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0630  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 
299 aa  195  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000148774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 
303 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 
297 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
297 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
296 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
297 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
290 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 
305 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 
300 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  37.87 
 
 
298 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
334 aa  192  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0108  transcriptional regulator, LysR family  41.76 
 
 
320 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.375048 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  35.07 
 
 
319 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  39.43 
 
 
313 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  39.43 
 
 
313 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
337 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  35.42 
 
 
317 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 
327 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1292  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
308 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  34.72 
 
 
314 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 
327 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
329 aa  185  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
308 aa  185  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  37.89 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  38.6 
 
 
308 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.6 
 
 
308 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 
305 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  34.38 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
337 aa  182  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 
305 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 
322 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  34.55 
 
 
298 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1631  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 
310 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4548  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
295 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 
303 aa  179  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4062  hypothetical protein  38.19 
 
 
302 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228225  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
300 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
294 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2817  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
296 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4465  transcriptional regulator, LysR family  35.31 
 
 
319 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00192923  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1502  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
293 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
308 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4402  transcriptional regulator, LysR family  35.31 
 
 
319 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 
305 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2180  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
297 aa  176  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000148525  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
296 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 
293 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 
297 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3233  transcriptional regulator, LysR family  37.87 
 
 
306 aa  175  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  33.1 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
293 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
294 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0880  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
295 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3595  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
293 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1191  putative transcriptional regulator  35.13 
 
 
290 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>