More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0448 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  608  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2350  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0727  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0714  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0263  transcriptional regulator, LysR family  40.08 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  39.69 
 
 		 307 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  34.05 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0637  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1656  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.191617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 302 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1656  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0262  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1748  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.8769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6344  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552099  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0701  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1735  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.11 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1292  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.24 
 
 		 308 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5031  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.361143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.76 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0630  transcriptional regulator, LysR family  29.63 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000148774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1524  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.19 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2436  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.56 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0199714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2348  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.56 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000261353  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2550  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.56 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2392  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.56 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  hitchhiker  0.00212314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2440  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.56 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.924518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0370  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.442789  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.53 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.19 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  32.19 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.19 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.19 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.19 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.19 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0352  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0902  transcriptional regulator, LysR family  31.93 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0478  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0101609  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0379  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  31.25 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.54 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  32.64 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1477  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.876533  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3233  transcriptional regulator, LysR family  35.77 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>