More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0910 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0910  transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3238  LysR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 286 aa  285  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1282  LysR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 286 aa  285  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497428  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3989  LysR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 286 aa  285  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 		 293 aa  138  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2284  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.471609  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1292  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0630  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000148774  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3968  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.456128  normal  0.373765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6402  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2695  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.537624  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  30.11 
 
 		 319 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0880  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302502 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3723  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 322 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  hitchhiker  0.00150053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0127  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2242  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.82 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1743  transcriptional regulator, LysR family  32.69 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3919  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2875  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 302 aa  99.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  27.99 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  27.99 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.34 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1513  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.83 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  30.34 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 334 aa  99.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 303 aa  99  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11030  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 314 aa  99  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3755  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0901244  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.27 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0861  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 325 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.43 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  24.48 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0726  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  31.66 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1988  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0141535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0138  ndhF3 operon transcriptional regulator  34.05 
 
 		 326 aa  96.3  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184087  normal  0.45783 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 304 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0524  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.79 
 
 		 293 aa  95.9  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2758  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.83 
 
 		 288 aa  95.9  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03305  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1326  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 322 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138103  normal  0.40975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.45 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.45 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.45 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.45 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  29.45 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  25.37 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.45 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.08 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  30.32 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  30.63 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1631  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3257  translation initiation factor IF-2  29.86 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4699  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 319 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>