More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6941 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 298 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  75.17 
 
 		 298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  54.11 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 298 aa  324  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0142  transcriptional regulator, LysR family  52.72 
 
 		 297 aa  322  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0902  transcriptional regulator, LysR family  50.68 
 
 		 307 aa  304  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0701  transcriptional regulator, LysR family  44.11 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4982  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 297 aa  208  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  36.95 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  40.59 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 319 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.54 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0437  LysR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 181 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 290 aa  188  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  38.43 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  40.44 
 
 		 293 aa  185  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 294 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0637  transcriptional regulator, LysR family  36.71 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2037  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0223119  hitchhiker  0.000202643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2817  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.29 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 318 aa  169  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0263  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1597  putative transcriptional regulator LysR-type  38.34 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  34.43 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.64 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  32.22 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0678  HTH-type transciptional regulator, LysR-family  33.56 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0849029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  33.83 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  33.83 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6028  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  33.83 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2263  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1110  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.68 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000488361  normal  0.138015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.18 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02191  putative Rubisco transcriptional regulator  34.13 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.989894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3638  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000174199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1513  putative Rubisco transcriptional regulator  33.79 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.15 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71090  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 308 aa  158  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.8 
 
 		 290 aa  158  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0221  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2790  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  34.66 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6168  putative transcriptional regulator  35.86 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220915  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1513  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  35.38 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4657  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>