More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2775 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
297 aa  567  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  52.43 
 
 
299 aa  244  9e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
302 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
295 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
295 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
297 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
296 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
289 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
297 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
297 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
297 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 
297 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
297 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
297 aa  158  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
297 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
297 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0262  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
294 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0434  transcriptional regulator, LysR family  37.92 
 
 
310 aa  158  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
297 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1978  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
296 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  0.0418865 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
297 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 
307 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
301 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
302 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2280  transcriptional regulator, LysR family  35.88 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1255  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
304 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 
303 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  37.31 
 
 
298 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6344  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
297 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1524  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
297 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365371  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1735  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
297 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4548  LysR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
295 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456524 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0958  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
297 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
297 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2291  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
300 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2158  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
300 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0300496  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2099  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
300 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 
298 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
311 aa  148  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0379  transcriptional regulator, LysR family  40.94 
 
 
307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1656  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.191617  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1656  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0352  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
307 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2711  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.991378  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3233  transcriptional regulator, LysR family  39.26 
 
 
306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363202 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1748  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.8769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1513  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 
326 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 
319 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0606  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
302 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.85701  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2293  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
301 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0370  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 
307 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.442789  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4369  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
324 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
308 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
314 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
299 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2307  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 
304 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.870686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2818  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
304 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246785  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 
316 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0524  transcriptional regulator, LysR family  38.73 
 
 
304 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
307 aa  142  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.84 
 
 
293 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0866  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.84 
 
 
293 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  35.84 
 
 
293 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5031  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.361143 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.84 
 
 
293 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0989  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179593 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.84 
 
 
293 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.49 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.84 
 
 
293 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.12 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.45 
 
 
292 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
294 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 
325 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2215  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.50368 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  35.64 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0263  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 
322 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1679  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2957  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.549224  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 
293 aa  139  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1110  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.42 
 
 
306 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000488361  normal  0.138015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
303 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
328 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1979  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
305 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454337  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 
295 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0351  transcriptional regulator, LysR family  39.26 
 
 
297 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.363543  normal  0.665208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  27.49 
 
 
296 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0172  transcriptional regulator, LysR family  39.26 
 
 
297 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2436  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.15 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0199714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2404  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000653141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2392  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.15 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  hitchhiker  0.00212314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>