More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2875 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2875  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  589  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3257  translation initiation factor IF-2  84.18 
 
 		 297 aa  474  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  36.69 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  34.44 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  36.14 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0880  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302502 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  26.28 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  31.09 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0701  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18090  transcriptional regulator  34.49 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.132657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  29.43 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 314 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.69 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 337 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2817  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4465  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00192923  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4402  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1733  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  31.14 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1292  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2851  transcriptional regulator, LysR family  31.78 
 
 		 314 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0142  transcriptional regulator, LysR family  29.48 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  26.79 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2282  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  29.19 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3960  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.583838  normal  0.331614 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1341  transcriptional regulator, LysR family  32.03 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2180  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000148525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4982  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0114  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3635  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 318 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287506  normal  0.0415744 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2269  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  27.95 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 308 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.82 
 
 		 308 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1390  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1692  rubisco operon transcriptional regulator  28.92 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.250885  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1449  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4548  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456524 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6040  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4369  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0263  transcriptional regulator, LysR family  28.46 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  30.26 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1597  putative transcriptional regulator LysR-type  32.13 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3384  LysR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  28.4 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3233  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363202 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  30.37 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>