More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5262 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4548  LysR family transcriptional regulator  73.31 
 
 		 295 aa  381  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  64.19 
 
 		 301 aa  358  6e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1679  LysR family transcriptional regulator  61.46 
 
 		 292 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 313 aa  305  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 313 aa  305  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3233  transcriptional regulator, LysR family  59.48 
 
 		 306 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2973  LysR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3595  LysR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 293 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0026  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 295 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.615193  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5152  transcriptional regulator, LysR family  56.27 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0030  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 299 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0029  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 299 aa  282  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1969  transcriptional regulator, LysR family  56.46 
 
 		 296 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0262  LysR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 294 aa  281  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1347  transcriptional regulator, LysR family  55.33 
 
 		 297 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.98443  normal  0.727871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 303 aa  275  9e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4369  LysR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0606  LysR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.85701  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2273  transcriptional regulator LysR family  51.39 
 
 		 294 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1873  LysR family transcriptional regulator  55.82 
 
 		 293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.367542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2090  LysR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 318 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0466986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0951  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 294 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2851  transcriptional regulator, LysR family  37.86 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4465  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00192923  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4402  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 303 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2817  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.83 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  39.08 
 
 		 294 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 293 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1535  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.15 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2754  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.15 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2672  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.15 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.92 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  36.62 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.68 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.34 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2180  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000148525  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1292  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.52 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  33.22 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  35.88 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0657  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0325779  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  32.88 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  34.02 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2495  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.05 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  35.62 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  32.88 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1537  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000701673  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 314 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3225  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.83 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.68 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.68 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.68 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.68 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  34.68 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.68 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71090  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  32.19 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>