More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0149 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  97.45 
 
 		 314 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  97.44 
 
 		 314 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  93.33 
 
 		 317 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  83.33 
 
 		 322 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  77.32 
 
 		 323 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  76.36 
 
 		 331 aa  507  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  76.04 
 
 		 329 aa  507  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02191  putative Rubisco transcriptional regulator  78.14 
 
 		 316 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.989894 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1513  putative Rubisco transcriptional regulator  77.81 
 
 		 316 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  66.99 
 
 		 336 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 329 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  65.27 
 
 		 327 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  65.27 
 
 		 327 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  66.56 
 
 		 322 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  65.69 
 
 		 337 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 337 aa  424  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  64.82 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  34.49 
 
 		 314 aa  175  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 318 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 301 aa  170  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1631  transcriptional regulator, LysR family  32.79 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2851  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  30.87 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 296 aa  162  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4402  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4465  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00192923  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 307 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 293 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 307 aa  159  8e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 294 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 314 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.4 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 294 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  34.18 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3595  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2919  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.395037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0657  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0325779  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  32.85 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1969  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1597  putative transcriptional regulator LysR-type  32.42 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 290 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0873  transcriptional regulator, LysR family  32.07 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.164971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 314 aa  143  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  29.63 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3039  rubisco operon transcriptional regulator  28.9 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.670925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.96 
 
 		 290 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4369  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 296 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>