More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1749 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 337 aa  691    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  90.75 
 
 		 337 aa  626  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  81.93 
 
 		 334 aa  546  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  83.12 
 
 		 322 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  82.75 
 
 		 329 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  77.91 
 
 		 327 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  77.91 
 
 		 327 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  79.61 
 
 		 336 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  67.86 
 
 		 331 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  67.53 
 
 		 323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  66.23 
 
 		 329 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  67.53 
 
 		 322 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  66.01 
 
 		 314 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  65.58 
 
 		 317 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  66.01 
 
 		 314 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  65.69 
 
 		 319 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02191  putative Rubisco transcriptional regulator  67.32 
 
 		 316 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.989894 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1513  putative Rubisco transcriptional regulator  67.32 
 
 		 316 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 307 aa  192  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  31.95 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  31.95 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 301 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2851  transcriptional regulator, LysR family  33.12 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.45 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  32.38 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  32.48 
 
 		 301 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 314 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0637  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 312 aa  159  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 316 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4465  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 319 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00192923  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  32.98 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4402  transcriptional regulator, LysR family  32.57 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 298 aa  156  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  34.24 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1631  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  30.55 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  29 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 300 aa  149  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 296 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 308 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  29 
 
 		 305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1292  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  30.31 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3233  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363202 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 329 aa  143  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2350  transcriptional regulator, LysR family  30.34 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4548  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 297 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 298 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  29.75 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>