More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1477 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  618  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1945  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 300 aa  252  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2919  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.395037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1516  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1421  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2442  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 337 aa  148  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  32.99 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  32.53 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  31.27 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  31.03 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  31.83 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 337 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  31.14 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  32.18 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2269  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  31.49 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  31.14 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  31.14 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.82 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  31.7 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  29.76 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  29.31 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  33.72 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  31.14 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1449  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 336 aa  132  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.01 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  28.97 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0880  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 295 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302502 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 309 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 323 aa  129  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 297 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  30.5 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2410  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.975942  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  30.5 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1733  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>