More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0883 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 291 aa  597  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1988  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  33.22 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2639  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4697  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168024  normal  0.0438452 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  35.47 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6028  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276744 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4657  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 312 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4365  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000557933  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 294 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1508  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000734154  hitchhiker  0.000350474 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 301 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2263  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  29.93 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2790  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  29.6 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2401  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  31.21 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 337 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  31.52 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1502  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  31.88 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2747  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 305 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437645  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  32.95 
 
 		 317 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  32.95 
 
 		 314 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0880  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302502 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  27.87 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  30.16 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  30.16 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5931  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145733  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  31.1 
 
 		 331 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  32.56 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 336 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  27.87 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 325 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  32.43 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4477  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3039  rubisco operon transcriptional regulator  30.38 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.670925  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4062  hypothetical protein  31.71 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228225  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  32.79 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3638  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000174199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1390  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1692  rubisco operon transcriptional regulator  30.34 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.250885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2131  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  30.24 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 314 aa  132  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.24 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  30 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>