More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1449 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1449  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 336 aa  677    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1403  LysR family transcriptional regulator  72.67 
 
 		 335 aa  487  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2549  LysR family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 337 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.30655  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0187  transcriptional regulator, LysR family  51.16 
 
 		 322 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.502015  normal  0.832957 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1689  transcriptional regulator CysB  27.99 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372652  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003883  regulatory protein CysB  28.33 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.803514  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0301  transcriptional regulator CysB  28.48 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  31.15 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01793  transcriptional regulator CysB  28.67 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  31.74 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3236  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.1 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1497  transcriptional regulator CysB  27.65 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000166035  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0970  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 303 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51620  LysR family transcriptional regulator protein  33.68 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  32.77 
 
 		 333 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  31.65 
 
 		 324 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 337 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  30.17 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1979  transcriptional regulator CysB  27.4 
 
 		 323 aa  126  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2649  transcriptional regulator CysB  25.94 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3454  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  29.61 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 314 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1856  transcriptional regulator CysB  27.53 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.314733  hitchhiker  2.57931e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  29.49 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01251  DNA-binding transcriptional dual regulator, O-acetyl-L-serine-binding  27.53 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2374  transcriptional regulator, LysR family  27.53 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00240492  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1501  transcriptional regulator CysB  27.53 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7918  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2353  transcriptional regulator CysB  27.53 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0011024  unclonable  0.000000022716 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1384  transcriptional regulator CysB  27.53 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1475  transcriptional regulator CysB  27.53 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1907  transcriptional regulator CysB  27.53 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524894  hitchhiker  2.34231e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01261  hypothetical protein  27.53 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1731  transcriptional regulator CysB  25.94 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171097  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1587  transcriptional regulator CysB  25.94 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296126  normal  0.104148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1662  transcriptional regulator CysB  25.94 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0319237  unclonable  0.0000181404 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  29.08 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  29.87 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  0.00000124662 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2161  transcriptional regulator, LysR family  26.58 
 
 		 324 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281423  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  30.79 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  30.79 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2195  transcriptional regulator CysB  27.53 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  31.19 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  30.1 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  30.1 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  30.1 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  30.1 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  30.1 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1923  transcriptional regulator, LysR family  26.9 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  30.1 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  30.1 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1434  transcriptional regulator CysB  27.13 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1844  transcriptional regulator CysB  27.13 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1902  transcriptional regulator CysB  27.13 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  hitchhiker  4.2824e-16 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2656  transcriptional regulator CysB  26.58 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00546956  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  30.2 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000279611  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  30.1 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  30.77 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1840  transcriptional regulator CysB  27.13 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000484032 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  31.4 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  29.15 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  29.62 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2016  transcriptional regulator CysB  25.63 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2469  transcriptional regulator CysB  29.49 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1615  transcriptional regulator CysB  27.13 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000907367 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  29.68 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  31.16 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2317  transcriptional regulator CysB  25.63 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2248  transcriptional regulator CysB  26.19 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.841929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  31.51 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 354 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  29.68 
 
 		 313 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  29.35 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  28.81 
 
 		 324 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  29.35 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4062  hypothetical protein  33.68 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228225  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  29.97 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  29.68 
 
 		 308 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  29.68 
 
 		 308 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  29.63 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  28.81 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  29.15 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  29.68 
 
 		 308 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>