More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1310 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  659    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  64.77 
 
 		 316 aa  415  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  64.75 
 
 		 309 aa  407  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  63.79 
 
 		 316 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  64.75 
 
 		 309 aa  407  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  61.08 
 
 		 314 aa  398  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3312  transcriptional regulator, LysR family  57.97 
 
 		 301 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.782402 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1091  transcriptional regulator, LysR family  54.86 
 
 		 300 aa  335  5.999999999999999e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0873  transcriptional regulator, LysR family  52.3 
 
 		 325 aa  331  9e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.164971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1502  LysR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 293 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2625  transcriptional regulator  54.11 
 
 		 313 aa  329  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.172216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2282  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 316 aa  317  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4062  hypothetical protein  51.21 
 
 		 302 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228225  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1390  transcriptional regulator, LysR family  50.51 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1692  rubisco operon transcriptional regulator  50.17 
 
 		 332 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.250885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0634  transcriptional regulator, LysR family  52.41 
 
 		 310 aa  308  6.999999999999999e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 318 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 326 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3039  rubisco operon transcriptional regulator  46.64 
 
 		 318 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.670925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  45.27 
 
 		 316 aa  298  7e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 309 aa  298  9e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0213  transcriptional regulator, LysR family  48.63 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0852  LysR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 317 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4697  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 314 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168024  normal  0.0438452 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  43.84 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  43.84 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6028  transcriptional regulator, LysR family  44.37 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2263  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2790  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2055  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 297 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.66522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1245  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000547224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  42.9 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4657  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 312 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4365  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 316 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000557933  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0425  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2930  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2254  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0160178  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2639  transcriptional regulator  43.49 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1620  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5931  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145733  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5512  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2047  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  41.08 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.595043  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1988  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 311 aa  255  8e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0141535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4044  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 326 aa  255  8e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1096  transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.816594  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4477  transcriptional regulator, LysR family  40.58 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5397  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal  0.012277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5348  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.14 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5126  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3638  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000174199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5257  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6226  putative transcriptional regulator  41.81 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02040  transcriptional regulator, LysR family  42.95 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.65232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71750  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1550  LysR, substrate-binding  42.07 
 
 		 319 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6474  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.254118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0138  ndhF3 operon transcriptional regulator  45.21 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184087  normal  0.45783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5641  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4480  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 320 aa  243  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.678379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2423  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2401  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 314 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0426  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 308 aa  225  7e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1979  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1394  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2283  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0424839  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5950  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0318  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3560  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 322 aa  205  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0436094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6402  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 306 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0693  RuBisCo operon transcriptional regulator  34.59 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 329 aa  202  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1508  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000734154  hitchhiker  0.000350474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1326  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138103  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0918  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 329 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1554  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3919  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0978  LysR substrate-binding  36.45 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2114  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0942  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3755  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0901244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3757  rubisco operon transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3927  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0151665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2414  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3968  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.456128  normal  0.373765 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2695  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.537624  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0835  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3442  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0866  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1743  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0930  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0920  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 332 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>