More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1296 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 320 aa  655    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  96.56 
 
 		 320 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  96.56 
 
 		 320 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  59.21 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  58.22 
 
 		 312 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  54.58 
 
 		 306 aa  363  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  54.93 
 
 		 313 aa  362  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  54.28 
 
 		 323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  53.9 
 
 		 308 aa  352  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  52.67 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  52.67 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  52.67 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  52.67 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  52.67 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  52.67 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  52.67 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  52.67 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  53.04 
 
 		 308 aa  352  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  53.04 
 
 		 308 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  53.04 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  53.04 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  52.53 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  53.95 
 
 		 313 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  53.04 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  51.62 
 
 		 308 aa  348  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  51.62 
 
 		 308 aa  348  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 354 aa  348  7e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  54.28 
 
 		 313 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  52.46 
 
 		 324 aa  347  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  50.97 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  50.97 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  51.63 
 
 		 313 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  53.29 
 
 		 324 aa  345  8e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  51.96 
 
 		 326 aa  345  8.999999999999999e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  50.8 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  50.8 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  50.8 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  50.8 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  51.12 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  50.8 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  52.63 
 
 		 324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891923 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2469  transcriptional regulator CysB  49.67 
 
 		 324 aa  342  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  52.63 
 
 		 313 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  51.64 
 
 		 313 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  51.64 
 
 		 313 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  51.64 
 
 		 313 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  51.64 
 
 		 313 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  51.64 
 
 		 313 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  51.64 
 
 		 313 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  51.64 
 
 		 313 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  51.64 
 
 		 313 aa  341  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  50.48 
 
 		 313 aa  341  9e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  52.63 
 
 		 313 aa  340  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  52.3 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  52.3 
 
 		 313 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  50.66 
 
 		 313 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  52.61 
 
 		 335 aa  339  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  52.3 
 
 		 324 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 312 aa  339  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  51.97 
 
 		 324 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  52.3 
 
 		 324 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  50.99 
 
 		 325 aa  338  9e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  51.64 
 
 		 324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000142013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  51.48 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2279  Cys regulon transcriptional activator  51.97 
 
 		 324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0003435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  51.64 
 
 		 324 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  51.64 
 
 		 324 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1928  transcriptional regulator CysB  51.64 
 
 		 324 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0221409  hitchhiker  0.0000000000199307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  49.19 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1324  transcriptional regulator CysB  50 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1805  transcriptional regulator CysB  49.01 
 
 		 324 aa  332  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  0.0101242 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1497  transcriptional regulator CysB  48.68 
 
 		 324 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000166035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2656  transcriptional regulator CysB  50.33 
 
 		 324 aa  332  7.000000000000001e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00546956  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1840  transcriptional regulator CysB  50.33 
 
 		 324 aa  331  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000484032 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1902  transcriptional regulator CysB  50.33 
 
 		 324 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  hitchhiker  4.2824e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1434  transcriptional regulator CysB  50.33 
 
 		 324 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1923  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1844  transcriptional regulator CysB  50.33 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679598 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2228  transcriptional regulator CysB  50 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000587269  hitchhiker  0.00110252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1922  transcriptional regulator CysB  50 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.303693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2032  transcriptional regulator CysB  50 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30659  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01251  DNA-binding transcriptional dual regulator, O-acetyl-L-serine-binding  49.67 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2374  transcriptional regulator, LysR family  49.67 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00240492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1615  transcriptional regulator CysB  50.33 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000907367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1475  transcriptional regulator CysB  49.67 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1384  transcriptional regulator CysB  49.67 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2353  transcriptional regulator CysB  49.67 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0011024  unclonable  0.000000022716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1907  transcriptional regulator CysB  49.67 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524894  hitchhiker  2.34231e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01261  hypothetical protein  49.67 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1501  transcriptional regulator CysB  49.67 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7918  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2248  transcriptional regulator CysB  49.18 
 
 		 325 aa  329  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.841929  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1856  transcriptional regulator CysB  49.67 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.314733  hitchhiker  2.57931e-19 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2016  transcriptional regulator CysB  49.34 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  49.34 
 
 		 313 aa  329  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2317  transcriptional regulator CysB  49.34 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003883  regulatory protein CysB  48.68 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.803514  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  51.19 
 
 		 314 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000279611  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2096  transcriptional regulator CysB  49.01 
 
 		 324 aa  328  9e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00807982  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1731  transcriptional regulator CysB  48.68 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171097  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1587  transcriptional regulator CysB  48.68 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296126  normal  0.104148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>