More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2549 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2549  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 337 aa  693    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.30655  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1449  LysR family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 336 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1403  LysR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 335 aa  332  5e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0187  transcriptional regulator, LysR family  46.15 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.502015  normal  0.832957 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  31.31 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  31.31 
 
 		 320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1537  transcriptional regulator CysB  28.48 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000242596  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  30.64 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003883  regulatory protein CysB  28.62 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.803514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  31.54 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  30.64 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1497  transcriptional regulator CysB  27.95 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000166035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1324  transcriptional regulator CysB  28.28 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1624  transcriptional regulator CysB  28.15 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.239161  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1689  transcriptional regulator CysB  29.14 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372652  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2839  transcriptional regulator CysB  27.81 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  hitchhiker  0.00000219555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1805  transcriptional regulator CysB  28.15 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  0.0101242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01251  DNA-binding transcriptional dual regulator, O-acetyl-L-serine-binding  27.95 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2374  transcriptional regulator, LysR family  27.95 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00240492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1475  transcriptional regulator CysB  27.95 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2353  transcriptional regulator CysB  27.95 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0011024  unclonable  0.000000022716 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01261  hypothetical protein  27.95 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1907  transcriptional regulator CysB  27.95 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524894  hitchhiker  2.34231e-17 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1384  transcriptional regulator CysB  27.95 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1450  transcriptional regulator CysB  28.05 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000786748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1501  transcriptional regulator CysB  27.95 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7918  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1856  transcriptional regulator CysB  27.95 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.314733  hitchhiker  2.57931e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  28.96 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1928  transcriptional regulator CysB  28.96 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0221409  hitchhiker  0.0000000000199307 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0301  transcriptional regulator CysB  27.27 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2649  transcriptional regulator CysB  27.15 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  28.96 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2161  transcriptional regulator, LysR family  27.95 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281423  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01793  transcriptional regulator CysB  27.95 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  30.64 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1624  transcriptional regulator CysB  28.19 
 
 		 324 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.483368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1945  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 300 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  29.97 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  29.43 
 
 		 324 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1662  transcriptional regulator CysB  27.15 
 
 		 324 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0319237  unclonable  0.0000181404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1587  transcriptional regulator CysB  27.15 
 
 		 324 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296126  normal  0.104148 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1731  transcriptional regulator CysB  27.15 
 
 		 324 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171097  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  30.41 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  28.62 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1979  transcriptional regulator CysB  27.03 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  29.47 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  28.62 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000142013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2279  Cys regulon transcriptional activator  28.62 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0003435  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1923  transcriptional regulator, LysR family  27.95 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2096  transcriptional regulator CysB  27.81 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00807982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  29.93 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2957  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.549224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2195  transcriptional regulator CysB  27.61 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1513  transcriptional regulator, LysR family  34.3 
 
 		 326 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01945  transcriptional regulator CysB  26.98 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00567188  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 329 aa  122  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  28.96 
 
 		 324 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  29.05 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5092  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1434  transcriptional regulator CysB  27.61 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1902  transcriptional regulator CysB  27.61 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  hitchhiker  4.2824e-16 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5247  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  29.77 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3242  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.42821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2248  transcriptional regulator CysB  27.06 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.841929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  28.96 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2016  transcriptional regulator CysB  26.94 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1844  transcriptional regulator CysB  27.61 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679598 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2317  transcriptional regulator CysB  26.94 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  27.95 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1827  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.140863  hitchhiker  0.00393629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2983  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1033  transcriptional regulator CysB  28.43 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.113266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1615  transcriptional regulator CysB  27.61 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000907367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.31 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5858  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.845274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1840  transcriptional regulator CysB  27.27 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000484032 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4320  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279054  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5002  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  27.04 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891923 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  26.57 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2656  transcriptional regulator CysB  26.6 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00546956  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  29.43 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 290 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  27.95 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2032  transcriptional regulator CysB  27.27 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2228  transcriptional regulator CysB  27.27 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000587269  hitchhiker  0.00110252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>