More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0847 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
320 aa  654    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
320 aa  654    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  96.56 
 
 
320 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  59.21 
 
 
308 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  58.55 
 
 
312 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  55.56 
 
 
306 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  55.59 
 
 
313 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  54.92 
 
 
308 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  53.67 
 
 
308 aa  355  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  53.67 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  53.67 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  53.67 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  53.67 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  53.67 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  53.67 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  53.67 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  54.05 
 
 
308 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  54.05 
 
 
308 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  54.05 
 
 
308 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  54.05 
 
 
308 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  54.28 
 
 
323 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  54.05 
 
 
308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  55.59 
 
 
313 aa  352  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  54.28 
 
 
313 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  53.27 
 
 
326 aa  352  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  53.72 
 
 
308 aa  351  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  53.72 
 
 
308 aa  351  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  51.95 
 
 
308 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  54.61 
 
 
324 aa  350  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  52.94 
 
 
313 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  51.95 
 
 
308 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  51.46 
 
 
354 aa  347  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  51.12 
 
 
313 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  53.62 
 
 
324 aa  346  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000891923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  53.95 
 
 
324 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  51.12 
 
 
313 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  52.22 
 
 
333 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  51.12 
 
 
313 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  53.95 
 
 
313 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  51.12 
 
 
313 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  51.12 
 
 
313 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  53.62 
 
 
313 aa  345  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  53.29 
 
 
324 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 
313 aa  344  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  50.8 
 
 
313 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  53.92 
 
 
335 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2469  transcriptional regulator CysB  50.33 
 
 
324 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  50.8 
 
 
313 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  53.29 
 
 
324 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000142013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2279  Cys regulon transcriptional activator  53.29 
 
 
324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0003435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  52.79 
 
 
324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  51.32 
 
 
313 aa  342  4e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  53.29 
 
 
324 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  52.96 
 
 
324 aa  341  9e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  51.96 
 
 
311 aa  341  9e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  53.29 
 
 
324 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  52.96 
 
 
324 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  51.97 
 
 
325 aa  341  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1928  transcriptional regulator CysB  52.96 
 
 
324 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0221409  hitchhiker  0.0000000000199307 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  51.32 
 
 
313 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  51.32 
 
 
313 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  51.32 
 
 
313 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  51.32 
 
 
313 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  51.32 
 
 
313 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  51.32 
 
 
313 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  51.32 
 
 
313 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  51.32 
 
 
313 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1324  transcriptional regulator CysB  50.99 
 
 
324 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  51.48 
 
 
312 aa  335  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1805  transcriptional regulator CysB  49.67 
 
 
324 aa  335  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  0.0101242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1840  transcriptional regulator CysB  51.32 
 
 
324 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000484032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1923  transcriptional regulator, LysR family  50.99 
 
 
324 aa  335  9e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1844  transcriptional regulator CysB  51.32 
 
 
324 aa  334  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2656  transcriptional regulator CysB  51.32 
 
 
324 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00546956  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1902  transcriptional regulator CysB  51.32 
 
 
324 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  hitchhiker  4.2824e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1434  transcriptional regulator CysB  51.32 
 
 
324 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2228  transcriptional regulator CysB  50.99 
 
 
324 aa  333  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000587269  hitchhiker  0.00110252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2248  transcriptional regulator CysB  50.16 
 
 
325 aa  333  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.841929  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1615  transcriptional regulator CysB  51.32 
 
 
324 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000907367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1922  transcriptional regulator CysB  50.99 
 
 
324 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.303693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2032  transcriptional regulator CysB  50.99 
 
 
324 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30659  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01251  DNA-binding transcriptional dual regulator, O-acetyl-L-serine-binding  50.66 
 
 
324 aa  332  4e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2374  transcriptional regulator, LysR family  50.66 
 
 
324 aa  332  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00240492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1907  transcriptional regulator CysB  50.66 
 
 
324 aa  332  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524894  hitchhiker  2.34231e-17 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1475  transcriptional regulator CysB  50.66 
 
 
324 aa  332  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01261  hypothetical protein  50.66 
 
 
324 aa  332  4e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1497  transcriptional regulator CysB  48.68 
 
 
324 aa  332  4e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000166035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2353  transcriptional regulator CysB  50.66 
 
 
324 aa  332  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0011024  unclonable  0.000000022716 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1384  transcriptional regulator CysB  50.66 
 
 
324 aa  332  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2096  transcriptional regulator CysB  50 
 
 
324 aa  332  4e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00807982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1856  transcriptional regulator CysB  50.66 
 
 
324 aa  332  4e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.314733  hitchhiker  2.57931e-19 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1501  transcriptional regulator CysB  50.66 
 
 
324 aa  332  4e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7918  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  49.67 
 
 
313 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  49.19 
 
 
309 aa  331  8e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  51.53 
 
 
314 aa  331  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000279611  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2195  transcriptional regulator CysB  50.99 
 
 
324 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000422628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1731  transcriptional regulator CysB  49.34 
 
 
324 aa  331  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171097  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1624  transcriptional regulator CysB  50 
 
 
324 aa  330  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.483368  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1587  transcriptional regulator CysB  49.34 
 
 
324 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296126  normal  0.104148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1662  transcriptional regulator CysB  49.34 
 
 
324 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0319237  unclonable  0.0000181404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>