More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5470 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
300 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  95 
 
 
300 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  94.67 
 
 
300 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  94.33 
 
 
300 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  94.67 
 
 
308 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  94.67 
 
 
308 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  91.67 
 
 
300 aa  564  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  75.25 
 
 
300 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  74.92 
 
 
300 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  75.25 
 
 
300 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2704  LysR family transcriptional regulator  75.25 
 
 
300 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  74.05 
 
 
308 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  75.25 
 
 
300 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  75.25 
 
 
300 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  75.25 
 
 
300 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  74.74 
 
 
308 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1832  LysR family transcriptional regulator  76.95 
 
 
300 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  70.1 
 
 
298 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  65.85 
 
 
295 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  65.04 
 
 
295 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  48.96 
 
 
298 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  46.02 
 
 
297 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
299 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  46.92 
 
 
302 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  46.79 
 
 
307 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 
299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
295 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3793  LysR family transcriptional regulator  43.8 
 
 
304 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3676  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
317 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0657  transcriptional regulator, LysR family  41.47 
 
 
305 aa  221  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
296 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
296 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  42.21 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1196  LysR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254346  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0175  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 
302 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  43.21 
 
 
296 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  43.21 
 
 
296 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  39.52 
 
 
301 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  36.86 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  36.86 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
302 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  36.86 
 
 
301 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
301 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
301 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  36.86 
 
 
301 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  36.86 
 
 
301 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 
305 aa  198  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 
304 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  42.8 
 
 
323 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
316 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
297 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  40.99 
 
 
318 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  43.95 
 
 
298 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
293 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
296 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
328 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
328 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
297 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
304 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  39.11 
 
 
306 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  39.11 
 
 
306 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 
307 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
305 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 
289 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
301 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
326 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
326 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
326 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 
303 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2740  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
297 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
305 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  39.93 
 
 
331 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 
303 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
304 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 
294 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  42.26 
 
 
295 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
299 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
305 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  40.07 
 
 
306 aa  185  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  42.49 
 
 
302 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
305 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
299 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2421  LysR substrate-binding  34.05 
 
 
300 aa  185  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 
297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  38.58 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  39.47 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  45 
 
 
337 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5151  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1334  LysR substrate-binding  34.92 
 
 
307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.622556  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>