More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3776 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 314 aa  641    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  42.4 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  38.52 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 290 aa  185  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 302 aa  182  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  35.89 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  35.89 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  38.65 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 296 aa  169  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0263  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0637  transcriptional regulator, LysR family  35.48 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  32.09 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1902  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1631  transcriptional regulator, LysR family  32.74 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6168  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220915  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0630  transcriptional regulator, LysR family  35.13 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000148774  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71090  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.68 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  34.28 
 
 		 295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 318 aa  155  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 337 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2037  transcriptional regulator, LysR family  32.06 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0223119  hitchhiker  0.000202643 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  34.17 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0902  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3233  transcriptional regulator, LysR family  34.7 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363202 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  33.69 
 
 		 322 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1597  putative transcriptional regulator LysR-type  35.77 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  32.4 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  32.75 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1513  putative Rubisco transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 298 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  32.4 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02191  putative Rubisco transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.989894 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  32.5 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  32.27 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  32.06 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4982  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  31.38 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2423  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6028  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1292  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2263  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>