More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2282 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  47.77 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 295 aa  228  9e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 		 295 aa  225  8e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0263  transcriptional regulator, LysR family  37.55 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 307 aa  178  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 316 aa  176  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  35.66 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1014  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 296 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2639  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1737  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 319 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 293 aa  165  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2350  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0698  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.79 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1631  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1477  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.876533  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1502  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2983  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 298 aa  158  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1694  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0987  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2037  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0223119  hitchhiker  0.000202643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 314 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4062  hypothetical protein  32.78 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228225  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5247  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0959  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4320  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279054  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5002  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5858  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.845274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0637  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3242  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.42821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5092  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3039  rubisco operon transcriptional regulator  32.19 
 
 		 318 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.670925  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0108  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.375048 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2930  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 320 aa  152  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 294 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1978  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  0.0418865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0873  transcriptional regulator, LysR family  31.63 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.164971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  30.07 
 
 		 323 aa  148  9e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1096  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.816594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0426  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5126  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  30.55 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1988  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0141535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1390  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1692  rubisco operon transcriptional regulator  31.25 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.250885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>