More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3406 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 309 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 309 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  71.48 
 
 		 316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3312  transcriptional regulator, LysR family  72.85 
 
 		 301 aa  447  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.782402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  73.13 
 
 		 316 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  69.83 
 
 		 314 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  64.75 
 
 		 323 aa  407  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1502  LysR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 293 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1091  transcriptional regulator, LysR family  55.36 
 
 		 300 aa  333  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0873  transcriptional regulator, LysR family  54.27 
 
 		 325 aa  328  9e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.164971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2625  transcriptional regulator  54.27 
 
 		 313 aa  324  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.172216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4062  hypothetical protein  49.66 
 
 		 302 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228225  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1692  rubisco operon transcriptional regulator  48.46 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.250885  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1390  transcriptional regulator, LysR family  48.46 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  47.7 
 
 		 309 aa  299  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2282  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 316 aa  295  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0213  transcriptional regulator, LysR family  48.97 
 
 		 315 aa  292  5e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 318 aa  291  9e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0852  LysR family transcriptional regulator  47 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0634  transcriptional regulator, LysR family  46.1 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3039  rubisco operon transcriptional regulator  44.37 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.670925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  47.46 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  45.24 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2055  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 297 aa  269  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.66522  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  43.29 
 
 		 303 aa  268  8e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  43.29 
 
 		 301 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1245  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 313 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000547224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4697  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 314 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168024  normal  0.0438452 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1620  transcriptional regulator, LysR family  44.07 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2254  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0160178  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6028  transcriptional regulator, LysR family  43.43 
 
 		 315 aa  262  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2263  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1988  LysR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 311 aa  258  7e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0141535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2790  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 309 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2639  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 302 aa  257  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  43.79 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4365  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000557933  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5931  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 307 aa  255  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145733  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4044  LysR family transcriptional regulator  42 
 
 		 326 aa  255  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 310 aa  255  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2930  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1550  LysR, substrate-binding  44.79 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2047  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  42.01 
 
 		 314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.595043  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4480  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.678379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4657  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 312 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.13 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2401  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0425  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6226  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 316 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0426  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 308 aa  245  9e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71750  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5512  transcriptional regulator, LysR family  39.26 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2423  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1096  transcriptional regulator, LysR family  41.69 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.816594  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4477  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0138  ndhF3 operon transcriptional regulator  41.87 
 
 		 326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184087  normal  0.45783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02040  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.65232  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3638  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 316 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000174199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5348  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 320 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5257  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 320 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5397  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 320 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal  0.012277 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6474  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.254118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5126  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 320 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5641  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 320 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1979  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1394  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1508  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000734154  hitchhiker  0.000350474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3968  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.456128  normal  0.373765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 316 aa  205  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1326  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138103  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0318  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 318 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2283  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0424839  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 329 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2114  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2414  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1554  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3560  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0436094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5950  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 323 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3755  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0901244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0693  RuBisCo operon transcriptional regulator  35.84 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2695  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.537624  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3723  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  hitchhiker  0.00150053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6402  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0896  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3442  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0930  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0920  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1743  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3106  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0866  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 325 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3757  rubisco operon transcriptional regulator  35.69 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1513  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0835  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3927  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 316 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0151665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>