More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2523 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  580  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  75 
 
 		 297 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  60.07 
 
 		 300 aa  359  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  58.68 
 
 		 305 aa  326  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  58.68 
 
 		 305 aa  326  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 298 aa  324  9e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  45.27 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1737  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2037  transcriptional regulator, LysR family  37.02 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0223119  hitchhiker  0.000202643 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0108  transcriptional regulator, LysR family  39.5 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.375048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  36.55 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 308 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2747  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437645  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4044  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1502  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  34.03 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1988  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0141535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4062  hypothetical protein  35.84 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228225  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1979  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  34.95 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  31.73 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  32.73 
 
 		 298 aa  158  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.95 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2625  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.172216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2930  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6028  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4657  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.75 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 314 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1477  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.876533  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  34.14 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.56 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  33.59 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1096  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.816594  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2263  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  31.37 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  32.88 
 
 		 323 aa  152  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1694  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 296 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1091  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 300 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  34.06 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4697  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168024  normal  0.0438452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  34.06 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2790  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0142  transcriptional regulator, LysR family  32.5 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0918  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.4 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4365  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000557933  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2639  transcriptional regulator  34.6 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  30.29 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1394  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0942  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 329 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0698  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  31.43 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2401  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0978  LysR substrate-binding  35.59 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950289 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0987  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0861  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 313 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  24.66 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>