More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4466 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  86.54 
 
 		 314 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  69.3 
 
 		 316 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  71.48 
 
 		 309 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  71.48 
 
 		 309 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  64.77 
 
 		 323 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3312  transcriptional regulator, LysR family  66.2 
 
 		 301 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.782402 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1091  transcriptional regulator, LysR family  57.99 
 
 		 300 aa  358  5e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2625  transcriptional regulator  55.78 
 
 		 313 aa  348  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.172216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0873  transcriptional regulator, LysR family  55.23 
 
 		 325 aa  345  8e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.164971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1502  LysR family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 293 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1390  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1692  rubisco operon transcriptional regulator  50.34 
 
 		 332 aa  322  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.250885  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4062  hypothetical protein  49.49 
 
 		 302 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228225  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 311 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2282  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 316 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0213  transcriptional regulator, LysR family  50.68 
 
 		 315 aa  297  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  44.48 
 
 		 316 aa  291  9e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0852  LysR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 317 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3039  rubisco operon transcriptional regulator  46.44 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.670925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2254  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0160178  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1620  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 299 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0634  transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 		 310 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2055  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 297 aa  275  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.66522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 309 aa  275  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1245  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000547224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2639  transcriptional regulator  43.49 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2790  LysR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 309 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0425  LysR family transcriptional regulator  44.82 
 
 		 314 aa  262  4.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1988  LysR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0141535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4697  LysR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168024  normal  0.0438452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1550  LysR, substrate-binding  44.9 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4044  LysR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 326 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6028  transcriptional regulator, LysR family  41.86 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276744 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2263  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2930  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4365  LysR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 316 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000557933  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2401  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  41.33 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0138  ndhF3 operon transcriptional regulator  44.64 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184087  normal  0.45783 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4657  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2047  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  38.38 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.595043  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3638  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000174199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1096  transcriptional regulator, LysR family  42.33 
 
 		 300 aa  244  9e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.816594  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5931  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145733  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0426  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 308 aa  242  7e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2423  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02040  transcriptional regulator, LysR family  43.21 
 
 		 315 aa  238  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.65232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71750  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4480  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.678379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6226  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6474  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 327 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.254118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5512  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.37 
 
 		 316 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1979  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4477  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5641  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1394  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 305 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5126  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5348  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 320 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5397  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal  0.012277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5257  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 320 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1554  LysR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1508  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000734154  hitchhiker  0.000350474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3927  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0151665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5950  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1326  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138103  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3968  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.456128  normal  0.373765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2114  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1743  transcriptional regulator, LysR family  35.6 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  36.67 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3755  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0901244  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0693  RuBisCo operon transcriptional regulator  35.94 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6402  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3723  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  hitchhiker  0.00150053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2414  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2695  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.537624  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3560  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0436094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1919  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301552  normal  0.616957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3442  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0896  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0930  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3757  rubisco operon transcriptional regulator  35.49 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0920  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3919  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1513  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2957  LysR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.549224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2283  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0424839  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3106  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>