More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1976 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 294 aa  590  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 297 aa  235  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2747  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 305 aa  185  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2037  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 304 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0223119  hitchhiker  0.000202643 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  165  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  32.65 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1737  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 318 aa  152  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  32.97 
 
 		 314 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  32.97 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 337 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  31.41 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 337 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  31.29 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.27 
 
 		 286 aa  146  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 329 aa  145  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0108  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.375048 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  30.82 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4548  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  27.87 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.69 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0142  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  31.96 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  31.16 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  31.27 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0400  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  31.27 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1477  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.876533  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0026  LysR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.615193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 319 aa  138  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0701  transcriptional regulator, LysR family  31.37 
 
 		 307 aa  138  8.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3225  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.83 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  28.08 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4982  transcriptional regulator, LysR family  30.91 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_004310  BR0029  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5641  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 320 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0030  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2754  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.74 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2672  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.74 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1535  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.74 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.72 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 336 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.38 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2550  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.74 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2348  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.74 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000261353  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2392  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.74 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  hitchhiker  0.00212314 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2436  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.74 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0199714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2440  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.74 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.924518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3595  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1694  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0987  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>