More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2180 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2180  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000148525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  69.15 
 
 		 296 aa  421  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2817  LysR family transcriptional regulator  67.91 
 
 		 296 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1597  putative transcriptional regulator LysR-type  56.55 
 
 		 308 aa  325  5e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  55.05 
 
 		 294 aa  309  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1292  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 308 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4699  LysR family substrate binding transcriptional regulator  38.1 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2307  transcriptional regulator, LysR family  41.36 
 
 		 304 aa  215  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.870686  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0726  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 308 aa  215  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2818  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 304 aa  215  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246785  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.97 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.83 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.83 
 
 		 290 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38480  FinR, transcriptional regulator, LysR-family  44.79 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.38 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3225  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.52 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1535  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.3 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2672  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.3 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2754  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.3 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3384  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  38.89 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.32 
 
 		 293 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.32 
 
 		 293 aa  202  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.32 
 
 		 293 aa  202  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.32 
 
 		 293 aa  202  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  41.32 
 
 		 293 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.32 
 
 		 293 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2348  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.75 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000261353  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2550  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.75 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111574 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.32 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2392  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.75 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  hitchhiker  0.00212314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2440  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.75 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.924518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2436  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.75 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0199714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0127  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2758  putative DNA-binding transcriptional regulator  39.93 
 
 		 288 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3540  transcriptional regulator, LysR family  39 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1537  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000701673  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3312  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.33 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.404557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1110  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.18 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000488361  normal  0.138015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71090  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0657  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0325779  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0953  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 311 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0145345  decreased coverage  0.00704929 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1050  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0198617  normal  0.025944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6168  putative transcriptional regulator  39.5 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5712  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1478  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.43 
 
 		 347 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2680  transcriptional regulator, LysR family  43.25 
 
 		 308 aa  185  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.578382  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4612  transcriptional regulator, LysR family  40.43 
 
 		 298 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.681307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2495  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.03 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1907  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0678  HTH-type transciptional regulator, LysR-family  32.88 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0849029  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0783  transcriptional regulator, LysR family protein  33.33 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1501  transcriptional regulator, LysR family  40.08 
 
 		 268 aa  179  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205194  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1491  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.08 
 
 		 268 aa  179  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000696654  normal  0.0147604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0262  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 294 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002681  transcriptional regulator LysR family  34.95 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000951441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2284  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.471609  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2242  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.36 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1631  transcriptional regulator, LysR family  41.69 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.172115  normal  0.256911 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5196  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0861  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 325 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2531  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3816  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0677379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1679  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03305  transcriptional regulator  33.79 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0026  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 295 aa  168  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.615193  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3997  LysR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1857  LysR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110484  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0475  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111111  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2469  transcriptional regulator, LysR family protein  34.3 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0029  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1501  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0030  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1712  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3233  transcriptional regulator, LysR family  40.45 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1969  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.93 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2375  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  35.27 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1882  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0108244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>