More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1615 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 302 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 294 aa  241  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  37.82 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 296 aa  172  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  29.56 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  35.27 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2930  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 320 aa  156  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4044  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.93 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1902  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1988  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0141535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  29.76 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6402  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 306 aa  148  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 326 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3635  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287506  normal  0.0415744 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 297 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4857  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  35.82 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2851  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1091  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1783  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000134706  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2919  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.395037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 301 aa  142  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0951  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3960  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.583838  normal  0.331614 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3312  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.782402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3968  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.456128  normal  0.373765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3755  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0901244  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2695  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.537624  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0873  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.164971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1679  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  30.77 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4465  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00192923  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4402  transcriptional regulator, LysR family  31.09 
 
 		 319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2055  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.66522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.15 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.15 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.15 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  27.8 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  27.8 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  34.15 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.15 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.15 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  31.87 
 
 		 314 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3384  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1609  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0273727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1326  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138103  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.8 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>