More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0918 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0918  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2202  LysR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 307 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.871962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0442  LysR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 316 aa  318  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4124  transcriptional regulator, LysR family  45.27 
 
 		 308 aa  275  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.175412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4033  transcriptional regulator, LysR family  44.59 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00663025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1176  transcriptional regulator, LysR family  46.15 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000040335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1268  LysR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 335 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00300028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0530  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.979074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2941  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2882  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0449  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000587967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1206  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000040335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0630  transcriptional regulator, LysR family  28.63 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000148774  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1191  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 297 aa  93.2  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  28.11 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  26.56 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  28.11 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 308 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.22 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  25.17 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 318 aa  86.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  26.38 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  24.75 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  25.17 
 
 		 297 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  24.83 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  25.73 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  24.83 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  24.42 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1597  putative transcriptional regulator LysR-type  27.33 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  26.69 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  27.92 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.92 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  27.61 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3781  LysR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.852232  normal  0.126897 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.87 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  29.26 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  26.95 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3225  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.64 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  26.06 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2954  transcriptional regulator, LysR family  27.63 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000398128  unclonable  0.0000000375451 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  28.1 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  26.96 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2348  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.64 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000261353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2436  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.64 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0199714 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2550  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.64 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111574 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2440  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.64 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.924518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2392  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.64 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  hitchhiker  0.00212314 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2758  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.41 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2754  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.91 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1535  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.91 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2672  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.91 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2817  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  25.78 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  24.75 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0714  LysR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0698  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0478  transcriptional regulator, LysR family  27.09 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0101609  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1974  LysR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168317  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1694  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3143  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2571  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0727  LysR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2901  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.87 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.87 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  25.87 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.87 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.87 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.87 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  25.86 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>