More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3511 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  96.3 
 
 		 297 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  93.6 
 
 		 297 aa  570  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  94.28 
 
 		 297 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  93.94 
 
 		 297 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  93.94 
 
 		 297 aa  568  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  93.94 
 
 		 297 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  93.94 
 
 		 297 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  92.93 
 
 		 297 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  91.53 
 
 		 295 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  40.69 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 699 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2464  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 290 aa  168  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 290 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 290 aa  168  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2529  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 290 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2940  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00388333  hitchhiker  0.000000297916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  35.94 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2391  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2860  putative LysR substrate binding domain  30.87 
 
 		 314 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2838  LysR substrate binding domain protein  31 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2972  LysR substrate binding domain-containing protein  31.33 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2754  LysR substrate binding domain protein  31 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2856  LysR substrate binding domain protein  31 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  0.729486 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1470  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  31.4 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1812  putative LysR substrate binding domain-containing protein  30.93 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1636  putative LysR substrate binding domain  30.93 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1647  putative LysR substrate binding domain  30.93 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0636291  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1628  putative LysR substrate binding domain  30.93 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1695  putative LysR substrate binding domain  30.93 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2004  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3814  transcriptional regulator, LysR family  27.48 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 287 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1908  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.605315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02471  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.96 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.606343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1091  transcriptional regulator, LysR family  27.96 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0201845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2734  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0381749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1100  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00749087  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02435  hypothetical protein  27.96 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0548  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0804  transcription regulator protein  33 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1646  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2864  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0164886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  32.54 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8034  transcriptional regulator, LysR family  28.86 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0280  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01483  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.41 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1608  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2120  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2730  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.118271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2132  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01494  hypothetical protein  29.41 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1726  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  29.85 
 
 		 322 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 302 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2139  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1680  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>