More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8034 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8034  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 300 aa  597  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  28.86 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4317  transcriptional regulator, LysR family  38.95 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  28.86 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  28.86 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  28.86 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2323  transcriptional regulator, LysR family  32.1 
 
 		 307 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1631  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2086  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363313  normal  0.654508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2391  transcriptional regulator, LysR family  25.58 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2242  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.8 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4535  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2529  transcriptional regulator, LysR family  25.58 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  32.69 
 
 		 699 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 290 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2940  transcriptional regulator, LysR family  25.58 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00388333  hitchhiker  0.000000297916 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 290 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0896  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 321 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0937961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1817  hypothetical protein  34.15 
 
 		 321 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.504025  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0664  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  28.68 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2464  LysR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 290 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268812  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1424  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1638  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0454  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.499714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1661  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0706  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.897426  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2383  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2215  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.50368 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3989  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3238  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1282  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497428  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2284  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.471609  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3750  transcriptional regulator, LysR family  30.26 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195821  hitchhiker  0.00432039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2380  transcriptional regulator, LysR family  27.94 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3755  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0901244  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2329  transcriptional regulator, LysR family  27.94 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  25.74 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2928  transcriptional regulator, LysR family  29.13 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05922  transcriptional regulator  28.52 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3253  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  33.19 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  25.74 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0820  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.194336 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.91 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4697  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168024  normal  0.0438452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 302 aa  92.4  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2660  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  29.68 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  35.32 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  32.84 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  31.45 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  31.66 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0210  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  26.81 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  26.81 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>