More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A2391 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A2391  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
288 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2940  transcriptional regulator, LysR family  97.22 
 
 
288 aa  588  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00388333  hitchhiker  0.000000297916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2529  transcriptional regulator, LysR family  94.06 
 
 
290 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2464  LysR family transcriptional regulator  92.31 
 
 
290 aa  553  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  90.56 
 
 
290 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  90.91 
 
 
290 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  90.91 
 
 
290 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  90.91 
 
 
290 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  90.21 
 
 
290 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  87.8 
 
 
290 aa  528  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
308 aa  165  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 
293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
295 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
297 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 
297 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
297 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
297 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  30.24 
 
 
297 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  30.45 
 
 
297 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
297 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 
297 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  27.68 
 
 
314 aa  145  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 
699 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  29.12 
 
 
304 aa  132  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 
283 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  29.02 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 
299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 
283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1470  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  29.97 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
283 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
283 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  29.02 
 
 
283 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
283 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
283 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  29.31 
 
 
283 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02471  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.84 
 
 
293 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.606343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1091  transcriptional regulator, LysR family  26.84 
 
 
293 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0201845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2734  LysR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
293 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0381749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02435  hypothetical protein  26.84 
 
 
293 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1100  LysR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
293 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00749087  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2838  LysR substrate binding domain protein  28.52 
 
 
299 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2860  putative LysR substrate binding domain  28.52 
 
 
314 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.25895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2856  LysR substrate binding domain protein  28.52 
 
 
299 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  0.729486 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3814  transcriptional regulator, LysR family  25.57 
 
 
308 aa  118  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869159  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2972  LysR substrate binding domain-containing protein  28.52 
 
 
299 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627611  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2754  LysR substrate binding domain protein  28.52 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2864  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
293 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0164886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 
297 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2730  LysR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.118271  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 
297 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
297 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
297 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
297 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 
297 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8516  transcriptional regulator, LysR family  26.46 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  25.44 
 
 
316 aa  112  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  27.53 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.03 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  27.53 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0804  transcription regulator protein  27.8 
 
 
302 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  27.53 
 
 
288 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  27.53 
 
 
288 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4044  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
326 aa  109  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.46 
 
 
290 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
288 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  25.61 
 
 
296 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
297 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  26.21 
 
 
301 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0820  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 
302 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.194336 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.95 
 
 
286 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 
300 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3436  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
294 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
310 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.11 
 
 
290 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
300 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2930  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
320 aa  105  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
314 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
314 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  26.44 
 
 
302 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1908  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
292 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.605315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  25.34 
 
 
300 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>