More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2838 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2838  LysR substrate binding domain protein  100 
 
 		 299 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2860  putative LysR substrate binding domain  99.33 
 
 		 314 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2856  LysR substrate binding domain protein  99.33 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  0.729486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2972  LysR substrate binding domain-containing protein  99.33 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2754  LysR substrate binding domain protein  99 
 
 		 299 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3814  transcriptional regulator, LysR family  78.97 
 
 		 308 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2730  LysR family transcriptional regulator  78.97 
 
 		 293 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.118271  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02471  predicted DNA-binding transcriptional regulator  78.01 
 
 		 293 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.606343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1091  transcriptional regulator, LysR family  78.01 
 
 		 293 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0201845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2734  LysR family transcriptional regulator  78.01 
 
 		 293 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0381749  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2864  LysR family transcriptional regulator  77.59 
 
 		 293 aa  480  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0164886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1100  LysR family transcriptional regulator  78.01 
 
 		 293 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00749087  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02435  hypothetical protein  78.01 
 
 		 293 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1470  transcriptional regulator, LysR family  68.86 
 
 		 291 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2960  transcriptional regulator, LysR family  83.85 
 
 		 130 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2945  putative HTH-type transcriptional regulator YfiE  74.74 
 
 		 108 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 297 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 290 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 699 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2529  transcriptional regulator, LysR family  27.48 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2940  transcriptional regulator, LysR family  28.24 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00388333  hitchhiker  0.000000297916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2391  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2464  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  28.03 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  32.03 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  28.96 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6226  putative transcriptional regulator  30.31 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  28.38 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.97 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71750  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  28.68 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2817  LysR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2758  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.87 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.9 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6168  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2180  LysR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000148525  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0820  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.194336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  29.34 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  29.25 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1513  putative Rubisco transcriptional regulator  29.07 
 
 		 316 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02191  putative Rubisco transcriptional regulator  29.07 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.989894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0804  transcription regulator protein  30.27 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1662  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000992806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  29.71 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2818  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246785  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0280  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8676  transcriptional regulator, LysR family  27.97 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241599  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 314 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2307  transcriptional regulator, LysR family  28.96 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.870686  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  29.73 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71090  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  29.18 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6389  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0907959  normal  0.0995777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.67 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  28.51 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  28.29 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5880  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311857  normal  0.281069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>