More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0896 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  608  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 308 aa  275  7e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  44.14 
 
 		 699 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  40.54 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  40.67 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  38.11 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 293 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 307 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 304 aa  158  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2940  transcriptional regulator, LysR family  28.77 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00388333  hitchhiker  0.000000297916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2529  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2464  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2391  transcriptional regulator, LysR family  27.74 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1662  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000992806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2401  LysR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  30.45 
 
 		 288 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.13 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0880  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302502 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3638  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000174199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  26.9 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2860  putative LysR substrate binding domain  26.94 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 294 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2856  LysR substrate binding domain protein  26.94 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  0.729486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2838  LysR substrate binding domain protein  26.6 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6474  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.254118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2423  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2864  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0164886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1470  transcriptional regulator, LysR family  25.85 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  30.98 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4480  LysR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.678379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2754  LysR substrate binding domain protein  26.6 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  28.8 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0048  transcriptional regulator, LysR family  28.63 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.968768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  27.61 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3814  transcriptional regulator, LysR family  26.6 
 
 		 308 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2972  LysR substrate binding domain-containing protein  26.26 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0280  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02471  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.76 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.606343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1091  transcriptional regulator, LysR family  26.76 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0201845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1100  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00749087  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02435  hypothetical protein  26.76 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2734  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0381749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>