More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1907 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  628  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  47.96 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  49.31 
 
 		 699 aa  289  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 295 aa  275  7e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 297 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  39.36 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2529  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 290 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2464  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 290 aa  168  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2940  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00388333  hitchhiker  0.000000297916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2391  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 301 aa  152  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  32.34 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1470  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2864  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0164886  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02471  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.01 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.606343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1091  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0201845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02435  hypothetical protein  29.01 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2734  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0381749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1100  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00749087  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3814  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2730  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.118271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1662  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000992806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2856  LysR substrate binding domain protein  29.01 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  0.729486 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2860  putative LysR substrate binding domain  29.01 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25895 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2838  LysR substrate binding domain protein  28.67 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4032  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2754  LysR substrate binding domain protein  29.01 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2972  LysR substrate binding domain-containing protein  28.33 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2790  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2423  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6474  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.254118 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1668  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 296 aa  125  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1385  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134108  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  30.66 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2004  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4477  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2139  transcriptional regulator, LysR family  29.33 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.14 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1939  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01483  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.17 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2120  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01494  hypothetical protein  29.17 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1726  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1945  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4697  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168024  normal  0.0438452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6028  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2263  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1608  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2132  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1558  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4525  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1450  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1646  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3378  transcriptional regulator, LysR family  30.24 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587515  normal  0.118229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  34.02 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4480  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.678379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09570  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3818  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  30.34 
 
 		 283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5512  transcriptional regulator, LysR family  28.38 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>