More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2864 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2864  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0164886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02471  predicted DNA-binding transcriptional regulator  96.93 
 
 		 293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.606343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1091  transcriptional regulator, LysR family  96.93 
 
 		 293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0201845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2730  LysR family transcriptional regulator  96.59 
 
 		 293 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.118271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02435  hypothetical protein  96.93 
 
 		 293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1100  LysR family transcriptional regulator  96.93 
 
 		 293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00749087  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2734  LysR family transcriptional regulator  96.93 
 
 		 293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0381749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3814  transcriptional regulator, LysR family  95.9 
 
 		 308 aa  578  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2972  LysR substrate binding domain-containing protein  77.93 
 
 		 299 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2856  LysR substrate binding domain protein  77.93 
 
 		 299 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  0.729486 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2860  putative LysR substrate binding domain  77.59 
 
 		 314 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2754  LysR substrate binding domain protein  77.66 
 
 		 299 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2838  LysR substrate binding domain protein  77.59 
 
 		 299 aa  480  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1470  transcriptional regulator, LysR family  66.9 
 
 		 291 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2960  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 130 aa  265  8e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2945  putative HTH-type transcriptional regulator YfiE  91.84 
 
 		 108 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 699 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  32.07 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  27.55 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  27.54 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  26.97 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 300 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  29.83 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2529  transcriptional regulator, LysR family  27.24 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2464  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2940  transcriptional regulator, LysR family  27.24 
 
 		 288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00388333  hitchhiker  0.000000297916 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  26.23 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2391  transcriptional regulator, LysR family  27.15 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6226  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 314 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  33.07 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71750  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  29.46 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2758  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.28 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2037  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0223119  hitchhiker  0.000202643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2817  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.8 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6389  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0907959  normal  0.0995777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.27 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  31.01 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  29.27 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1733  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.96 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1662  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000992806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2307  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.870686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2818  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246785  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2180  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000148525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  25.5 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5516  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0587498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5880  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311857  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6168  putative transcriptional regulator  26.56 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0280  LysR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3308  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  29.34 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1597  putative transcriptional regulator LysR-type  28.02 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0820  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.194336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3312  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.782402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1398  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  30.12 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  24.91 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3436  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0953  transcriptional regulator, LysR family  27.41 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0145345  decreased coverage  0.00704929 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71090  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5370  LysR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.626785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2747  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4480  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 320 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.678379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0327  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 314 aa  96.3  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.05 
 
 		 316 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>